Fue esta serie, la única de Star Trek, la que en lugar de una nave espacial estaba totalmente ambientada en una estación espacial. No tuvo un comienzo feliz, considerando que se emitió casi junto con la serie Next Generation y luego con el Voyager, y muchos fans de la serie se decepcionaron inicialmente por no haber tenido lugar en una nave espacial. Pero a la larga esto se recompensó, de hecho después de los primeros episodios, las cosas cambiaron y esta serie fue muy popular. Ha habido muchas innovaciones, tanto para el escenario como para los personajes que caracterizaron esta serie.
Un poco de historia de esta estación espacial. Se encuentra cerca del planeta Bajor, que está situado justo en la frontera entre el espacio de la Federación Unida de Planetas y el espacio cardassiano que construyó esta estación. Tras la ocupación del planeta por Cardassia y una sangrienta guerra, los rebeldes bajoranos consiguieron expulsar a los cardassianos, apoderándose también de la estación espacial. Luego pidieron el apoyo de la Federación y, aunque permanecieron bajo la jurisdicción bajorana, Banjamin Sisko, un oficial de la Federación, fue nombrado para dirigir la estación espacial. Poco después de su inauguración, se descubrió el agujero de gusano que se comunica con otro cuadrante de la galaxia. Una vez que la estación espacial se trasladó a la entrada del túnel, se convirtió en un importante nodo de comunicación entre los cuadrantes. La estación espacial es muy grande. Consta de un anillo exterior que sirve de estación de acoplamiento para las naves espaciales, un anillo interior donde se encuentran las dependencias del personal y de los visitantes, y una parte central, que contiene un paseo con los diversos locales comerciales, el centro de mando y el reactor principal. Con el descubrimiento del agujero de gusano, se convierte en un puerto de intercambio entre cuadrantes, pero por desgracia el túnel también trae enemigos muy peligrosos al cuadrante de la estación.
A diferencia de las otras series de Star Trek, que eran casi exclusivamente episódicas, es decir, cada episodio tenía su propio principio y fin, esta serie prefería los episodios en períodos de tiempo más largos, contando también las historias del personal de la estación, con lo que los diversos episodios se vinculaban entre sí. Al principio al público no le gustaba esto, demasiado aficionado a ver el comienzo y el final de un episodio, pero luego fue esto lo que hizo que la serie fuera una de las más seguidas. Fue la primera serie no concebida por Roddemberry, quien lamentablemente murió en octubre de 1991, dejando el testigo a Rick Berman y Michael Piller, quienes tuvieron otra visión de Star Trek, y aunque dejaron atrás los valores que distinguían a la serie anterior, introdujeron y profundizaron temas nunca tratados en profundidad por otras series, como el racismo, la sexualidad, la política y especialmente la religión.
Ahora hablemos de los personajes que son muchos y muy importantes, tanto para la trama de la historia que tiene lugar en la estación espacial a lo largo de sus episodios, como para el personaje y el contexto en el que se mueve cada uno de ellos. El Capitán Benjamin Sisko, que comanda la estación espacial, llegó allí con su hijo Jake y durante los 7 años en los que se desarrolla la historia de Espacio Profundo Nueve, tiene un papel no sólo como comandante, sino también como Emisario de los Profetas, que son los Dioses del pueblo de Bajor, y por eso es tan bien recibido por la población. Es decidido, pero muy humano, a veces se equivoca, pero no tiene problemas para admitirlo. Es muy querido por los oficiales de la estación, y después de los primeros tiempos difíciles, en los que está muy encerrado en sí mismo, habiendo perdido a su esposa en la guerra, recupera poco a poco las ganas de vivir que había perdido, un ascenso en su carrera e incluso un nuevo compañero. En esto, un personaje único le ayuda mucho. Ella es Jadzia Dax, una oficial científica, que pertenece al pueblo trill. Tiene un simbionte dentro de ella que ha vivido siete vidas. La característica de estos simbiontes es que una vez que el cuerpo que los alberga muere, se introducen en otro cuerpo y continúan viviendo, teniendo dentro de sí mismos los recuerdos y experiencias de todas las vidas pasadas. Por lo tanto, tiene un carácter no bien definido, resultado de todos los legados adquiridos anteriormente, por lo que es una persona escrupulosa, fiable pero también contradictoria. Ayuda mucho al comandante Sisko en sus misiones, aunque no siempre esté de acuerdo con él y no dude en hacérselo saber. El comandante Sisko ya la conocía cuando estaba en el cuerpo de Curzon, que fue su anterior huésped, pero que era un hombre y tenía una profunda amistad con él.
Al llegar a la estación, el capitán Sisko se enfrenta a menudo con Kira Nerys, que es bajorana y es la oficial de enlace entre el gobierno de Bajor y la federación. No se adapta muy bien a los estrictos protocolos de la Federación Unida de Planetas y teme pasar de una tiranía, la de Cardassia, a otra de la Federación. Pero el capitán Sisko la convencerá de lo contrario y poco a poco se ganará su confianza incondicional y se convertirá en una de sus mejores personas. Odo, que está en la estación, también es un personaje único. Es un metamorfo, lo que significa que puede cambiar su forma humanoide en cualquier cosa. Ya estaba en la estación en la época de los cardassianos y se convierte en una valiosa ayuda para el capitán, ayudándole a mantener el orden en la estación. Orden que a menudo es caótico debido a otro personaje peculiar, un ferengi, que dirige el bar de la estación, con los puentes holográficos, que alquila y los diversos juegos. Es Quark, inicialmente un clásico ferengi, que ve sólo y exclusivamente el beneficio, sin importarle un comino todo lo demás. Pero con el tiempo, se descubre en él, muy profundamente, una vena de altruismo y bondad. Lo cual, sin embargo, él, como buen ferengi, trata de no mostrar. Hay otros personajes que merecen al menos ser mencionados, como el Dr. Bashir, Wolf, el Klingon, a quien también encontramos en La Próxima Generación, el sastre de la estación, Garac, el único cardassiano «bueno» de la galaxia, y O’Braian también como Wolf, el oficial del capitán Picard. Otros personajes menores pero recurrentes hacen que la historia que se desarrolla a lo largo de las 7 estaciones sea emocionante. No falta una guerra acalorada que viene del cuadrante más allá del agujero de gusano, una guerra sangrienta que pondrá a prueba a la Federación, a Bajor e incluso a Cardassia, pero que afectará a todo el cuadrante Alfa y que también permitirá que prevalezcan extrañas alianzas sobre los asaltantes.